Rizvan Khan, un joven musulmán, se muda de la India a Los Ángeles, donde vive su hermano después de la muerte de su madre. Khan no es como los demás, es un hombre que sufre el síndrome de Asperger. Un día, mientras Khan promociona los productos de su hermano conoce a la bella Mandira, una joven India que trabaja en una peluquería. Khan, a pesar de ser incapaz de expresar sus sentimientos, acaba enamorándose de esta mujer que pronto, y a pesar de las limitaciones en ciertos sentidos de Khan, ella también se acaba enamorando de él.
Una historia de amor, que junto al hijo de Mandira y que Khan acepta sin ninguna duda como su hijo, sufre un dramático giro el 11 de Septiembre de 2001, cuando las Torres Gemelas son derribadas. El pueblo estadounidense empieza a mirar mal a los musulmanes que residen en sus ciudades y todo lo que Mandira y Khan han conseguido fruto de su amor, se derrumba sin poder evitarlo.
Pero a pesar de que Khan es incapaz de expresar sus sentimientos, de que no tolere el color amarillo y odie los móviles porque sus ondas despistan a las abejas, no se rinde. Y quiere decir en persona al Presidente de los Estados Unidos "Mi nombre es Khan y no soy un terrorista". Dicha decisión hace que Khan emprenda un viaje en solitario mucho más difícil de lo que aparentaba inicialmente y pronto esta decisión llega a los medios de comunicación.
Katie es una joven de diecisiete años que tiene una rara enfermedad, que no le permite salir apenas de su casa, ya que si le da tan solo un poco el sol, puede traerle graves consecuencias, incluso la muerte.
Una noche sale y se encuentra casualmente con Charlie, que es el chico del que siempre ha estado enamorada y que lleva toda la vida observando desde su ventana, cuando pasa por delante de su casa.
Entre Katie y Charlie surge un profundo sentimiento y comienzan una bonita historia de amor, pero siempre citándose por las noches. Katie no se atreve a contarle nada sobre su enfermedad por miedo a perderlo, pero tras un trágico suceso, Charlie será consciente de que la vida de la chica a la que ama corre peligro.
